Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms