Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpraP18052 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms