Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms