Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms