Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rtf1A2AQ19 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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