Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Rnft1Q9DCN7 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rnft1Q9DCN7 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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