Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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