Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Apobec3Q99J72 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms