Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NischQ80TM9 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC8.78□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
NischQ80TM9 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
NischQ80TM9 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms