Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NipblQ6KCD5 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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