Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms