Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms