Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Siah1bQ06985 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms