Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pkp1P97350 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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