Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprkP35822 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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