Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms