Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms