Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spocd1B1ASB6 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms