Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms