Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms