Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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