Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms