Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Tmem253Q3UNB8 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Tmem253Q3UNB8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tmem253Q3UNB8 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms