Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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