Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Rpl28P41105 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms