Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms