Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RxraP28700 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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