Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms