Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
P10404 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms