Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MttpO08601 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
MttpO08601 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms