Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms