Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms