Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Atp8b5A3FIN4 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms