Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.1 ms