Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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