Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Atg4aQ8C9S8 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Atg4aQ8C9S8 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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