Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NipblQ6KCD5 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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