Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm28047Q3US59 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms