Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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