Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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