Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
VdrP48281 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms