Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RxraP28700 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RxraP28700 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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