Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PdgfraP26618 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PdgfraP26618 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PdgfraP26618 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PdgfraP26618 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PdgfraP26618 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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