Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm28038F7BCN9 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms