Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms