Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Grik3B1AS29 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms