Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hdac6Q9Z2V5 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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