Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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Usp18Q9WTV6 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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Usp18Q9WTV6 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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Usp18Q9WTV6 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Usp18Q9WTV6 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp18Q9WTV6 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp18Q9WTV6 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms