Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ube3bQ9ES34 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ube3bQ9ES34 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms