Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SgshQ9EQ08 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SgshQ9EQ08 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms